之前我们在《柱形图还能有什么新花样?分享9种柱形图! 》一文中,分享了生信分析中不同“花样”的柱状图。
除了柱形图外,常见的生信图形还有气泡图、散点图等等。今天跟大家分享几种常见的气泡图!(悄悄说,相关图形都能在基迪奥生信云平台OmicShare Tools中得同款哦~)
富集气泡图
展示富集结果的形式有很多,如富集条形图、富集气泡图、富集圈图等。富集气泡图可以说是文章中的“常客”。通过富集气泡图可以四个维度地展示富集数据。如富集的pathway/GO term、RichFactor、富集基因数、显著性大小等。
在OmicShare Tools使用(KEGG/GO)富集分析工具,可以直接得到各类型富集图的结果,其中就包含了富集气泡图。在动态KEGG(或GO)富集分析工具中,更可以对富集气泡图进行调整。
详情可戳往期推文介绍:《炫多配色富集图形,富集分析也能玩出花样!》
如果手头上已经有相关富集工具,那么使用OmicShare Tools的富集气泡图工具绘制就更易拿捏了!
链接:
https://www.omicshare.com/tools/home/report/report_enrich_diff_bubble.html
只需要按照示例文件及说明,筛选数据,即可出图,且还支持部分类目的个性化调整,多种配色可供选择!
富集差异气泡图
富集差异气泡图通过结合横纵坐标,可以对将显著性、及上下调基因数量情况进行展示。
如下图纵坐标越大,说明P-value越小,表示相对应的气泡越显著;横坐标为up-down normalization,该值越往右,说明上调基因数量较多;反之向左,说明下调基因数量较多。
OmicShare Tools中有两个富集差异气泡图工具,其中,动态富集差异气泡图得到初始结果后支持在线调整,气泡大小、配色等均可个性化自定义。具体教程可见《给气泡换个色~绘制赏心悦目的富集差异气泡图! 》。
链接:
https://www.omicshare.com/tools/home/report/report_enrich_diff_bubble.html
丰度气泡图
丰度气泡图(表达量分布气泡图),可以展示基因在样本(亚群/分组)的表达情况,同时也展示其显著性(或细胞表达占比),因此不少高分文章中也可见其身影!除了展示基因在样本间的表达分布,展示配受体对在不同细胞对之间的表达分布也同样适用!
OmiShare Tools同样有两个丰度气泡图工具,其中动态的支持在线调整,如对丰度气泡图进行横纵向切换等,更多功能,欢迎前往探索~~
链接:
https://www.omicshare.com/tools/home/report/report_scatter_bubble.html
横纵向切换
气泡图
除上述以外,最最基础的通过“气泡”形式展示数据的气泡图,在OmicShare Tools也有!!
链接:
https://www.omicshare.com/tools/Home/Soft/bubble
绘制效果如下:
好啦,各式气泡图,尽在OmicShare,快来实操体验吧!
云平台工具链接:
https://www.omicshare.com/tools/
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