当地时间13日，伊朗对以色列发动三波导弹袭击，导致以境内多处建筑物被击中，并造成至少50人受伤。当晚，伊朗最高领袖哈梅内伊通过官方媒体发表声明，称伊朗的报复行动已经开始。伊朗伊斯兰革命卫队发布声明表示，本轮针对以色列的袭击成功对包括军事中心和空军基地在内的数十个目标实施了“毁灭性精确打击”。

伊朗共和国通讯社发布的消息显示，伊朗在当晚的报复行动中向以色列发射了“数百枚”导弹。伊朗革命卫队发布的阶段性战报中没有提及发射导弹的具体数量，但表示有“数十枚”导弹突破了以色列的防空系统，准确击中了战略目标。媒体统计显示，至少有200枚导弹进入以色列领空，多处建筑物被击中。

哈梅内伊通过官方媒体发表声明，称伊朗武装部队将采取武力行动，彻底摧毁以色列政权。以色列军方消息人士称，美国正在帮助以色列拦截来自伊朗的导弹，美军的萨德反导系统参与了拦截行动。两名美国官员也表示，美国军方协助击落了射向以色列的伊朗导弹。

据伊朗迈赫尔通讯社报道，以色列当晚继续对伊朗发动猛烈空袭，伊朗首都德黑兰以及加兹温、伊斯法罕、赞詹等地多次发生巨大爆炸。德黑兰上空传出密集爆炸声，一些不明飞行物被拦截，火光四起。目前，该市水电供应较为正常，网络服务时断时续。以色列国防军表示，以空军当天早些时候袭击了伊朗第二大城市伊斯法罕附近的核设施。据以色列媒体报道，伊朗中部什叶派圣城库姆附近的福尔道核设施也在当晚遭到袭击。

伊朗国家电视台发布消息称，伊朗退出与美国的第六轮伊朗核问题谈判。此前，在阿曼斡旋下，美国和伊朗自今年4月以来已举行五轮间接会谈。伊朗外交部曾于6月10日凌晨发表声明说，伊朗将于15日与美国举行下一轮会谈。

俄罗斯总统普京分别与伊朗总统佩泽希齐扬和以色列总理内塔尼亚胡通电话。普京在同伊朗总统通话时表示，俄方谴责以色列违反联合国宪章和国际法的行径。伊朗总统表示，伊朗将对以色列的空袭做出“适合的”反击，同时强调伊朗无意拥有核武器。在同以色列总理通话时，普京强调了重启伊朗核计划谈判进程以及利用政治和外交手段解决相关问题的重要性，表达了俄方进行调解的意愿，以避免冲突进一步升级。

美国总统特朗普13日承认，美国事先知道以色列将袭击伊朗。他在接受媒体电话采访时说：“我们什么都知道”。他再度呼吁伊朗和美国就伊核问题达成协议，称现在还“为时不算太晚”。美联社援引匿名美国官员的话报道说，美军战斗机正在中东地区上空巡逻，以保护美国人员和设施。美国海军已指示能够防御弹道导弹的“托马斯·哈德纳”号驱逐舰驶往东地中海，另一艘驱逐舰也将前往待命。