以色列方面威胁要阻止国际组织“自由船队联盟”的船只向加沙地带运送援助物资，其中包括瑞典环保活动家格蕾塔·通贝里搭乘的“马德琳”号。6月1日，通贝里与另外11名志愿者从意大利西西里岛出发，向加沙运送婴儿奶粉、面粉、大米、医疗用品和净水设备等援助物资，以支援被围困、陷入饥荒的当地民众。一个月前，“自由船队联盟”的另一艘船只“良心”号在马耳他附近海域遭到两架无人机袭击，未能按计划成行。通贝里曾表示，所有证据都指向以色列是那次袭击的幕后黑手。

以色列4日警告称，将对“自由船队联盟”的船只采取措施。一名以色列高级国防官员表示，以方不会允许“马德琳”号进入加沙附近水域。如果船上人员违抗以军方命令，他们可能面临拘留，船只也可能被扣押。以色列国防部长卡茨预计将在4日就处置行动作出具体决定。

以色列国防军发言人埃菲·德弗林在接受英国《泰晤士报》采访时称，以方已做好准备应对此次事件，并将采取相应行动。然而，他并未透露更多细节。3日晚到4日凌晨，在“马德琳”号驶出希腊领海后，船只上空出现一架无人机，引发短暂混乱和恐慌，船员随后发出求救信号。这是连续第二晚有无人机在船只上空盘旋。船上的法国欧洲议会议员里玛·哈桑认为该无人机由希腊方面操控，并在社交平台上质疑其动机。半岛电视台报道称，该无人机后被证实隶属于希腊海岸警卫队。