6月25日，以色列对伊朗德黑兰进行空袭，造成多栋住宅楼损毁。6月28日，伊朗在首都德黑兰为牺牲的军事指挥官和科学家举行国葬。媒体报道称，在此次冲突中遇害的核科学家包括伊朗伊斯兰阿扎德大学校长、理论物理学家穆罕默德·迈赫迪·特赫兰奇以及曾任伊朗原子能组织负责人的核工程师费雷敦·阿巴西-达瓦尼等人。

以色列总理内塔尼亚胡声称，此次袭击已使伊朗的核计划推迟了数年。前政府官员和专家认为，袭击重创了伊朗快速推进核武器研发的能力。截至以伊此轮冲突停火生效时，至少11名遇害科学家中的多数人曾直接参与核弹头组件的测试与建造工作，包括引爆系统、高能炸药以及触发链式反应的中子源等关键部件。

伊朗外交部长阿拉格齐表示，伊朗始终是《不扩散核武器条约》的忠实成员，坚持在国际法框架下和平利用核能的权利，并无意寻求核武器。美国反扩散事务前国家安全主任埃里克·布鲁尔分析指出，若只是随时间推移缓慢流失专业人才，尚有缓冲余地来培养替代者。但若正全力推进核武研制，这种人才损失将造成更严重的冲击。

尽管以色列暗杀了多名核科学家，但伊朗仍拥有大批在该领域工作多年的科研人员。以色列于6月12日晚间至13日凌晨发动名为“纳尼亚”的行动，采用一种“特殊武器”暗杀了伊朗10名核科学家中的9人。第10名核科学家在其他9名科学家死后不久也被杀。这些核科学家都是在睡觉时被杀害的，以色列多年来一直在密切跟踪伊朗核科学家的动向，此次被杀的10名核科学家在去年11月被列入暗杀名单。

据科学与国际安全研究所所长戴维·奥尔布赖特透露，行动最重要的目标人物之一是阿巴西-达瓦尼。作为伊朗核开发相关工作的奠基人之一，阿巴西-达瓦尼曾担任伊朗秘密计划“阿马德工程”的管理者和高级顾问，其科研工作主要聚焦于中子引发器的研发。另一位遇害科学家是特赫兰奇，他曾负责高能炸药研究。

11天后，在以伊停火协议生效的几个小时前，伊朗北部地区发生袭击，造成另一名科学家赛义德·萨迪吉·萨贝尔死亡。他因被指控从事核武器相关工作而受到美国制裁。萨贝尔生前担任重要科研机构“沙希德·卡里米集团”负责人，该组织为伊朗国防创新与研究组织开展爆炸物相关研究项目。

核科学家一直是暗杀目标。自1950年以来，为埃及、伊朗和伊拉克核计划工作的科学家频频遭到暗杀。据称，美国和以色列对核科学家实施的袭击次数最多，英国和苏联也曾参与此类袭击。在以色列此次行动之前，已有10名参与伊朗核计划的科学家在袭击中丧生。

一名不愿具名的以色列高级官员表示，以情报机构相信杀死核科学家是“纳尼亚”行动中最重要的部分，因为伊朗的军事领导人和设施更容易被替代或修复，而核科学家的知识则需要更长时间才能重新掌握。然而，有证据显示，伊朗已建立起一套精密的核专才培养体系，使得伊朗在顶尖核科学家接连遇害的情况下，其核计划仍能持续推进。

过去20年间，伊朗通过沙希德·贝赫什提大学、谢里夫理工大学和马利克·阿什塔尔大学等高校，成功延续了其核武器研发能力。资深核科学家常与青年学子共同开展实验研究。美国佐治亚理工学院国际事务副教授詹娜·乔丹和雷切尔·惠特拉克认为，尽管以色列将科学家视为关键知识来源进行打击，但伊朗国内可能仍有数千名相关科研人员，这令针对科学家的打击效果存疑。二人还指出，以色列的策略风险极高，既可能无法有效遏制敌方核计划，又易引发公众愤慨并招致报复。