如果你正在开展非编码RNA与外泌体方面的研究,或者将要开展,那么希望本文能够对你有所帮助哦~
背景介绍
1)外泌体形成的过程:
a、早期核内体成熟为晚期核内体,其中多个腔内小泡(ILVs)是由内体膜向内出芽产生的。ILVs的积累导致多泡体(MVBs)的形成。
b、供体细胞产生的蛋白质和核酸在MVB形成过程中可进入小泡内。
c、外泌体通过MVB与细胞膜融合释放到细胞外环境。外泌体通过三种途径被受体细胞吸收:直接融合、受体介导的融合或内吞作用。
➤ 如下图所示:
A. LncRNA通过海绵吸附miRNA调控靶基因的表达
B. LncRNA可以与mRNA相互作用调控靶基因的表达
C. LncRNA作为不同蛋白的支架,形成核糖核蛋白(RNP)复合物,调控基因表达
D. LncRNA引导表观遗传修饰物改变染色质结构、组蛋白甲基化/乙酰化水平以及DNA甲基化水平
E. LncRNA与转录复合体相互作用,作为诱导物促进或抑制基因转录
F. LncRNA还具有促进或抑制基因转录的功能
文献解析
1)机制图展示一
2)反义转录
3)思路解析
4)结果展示
5)机制图展示二
6)思路解析
7)结果展示
总结借鉴
1)如何确定一段序列是否为IncRNA
➤ 5’RACE和3’RACE得到全长
➤ Northern blotting检测
➤ ORF finder预测
➤ Coding Potential Calculator (CPC)/ Coding Potential Assessment Tool (CPAT) 预测其编码蛋白的能力
➤ FISH检测在细胞中的定位
2)FISH检测在细胞中的定位
➤ Blast得到LncRNA与靶基因的高度互补区域
➤ RNA pull-down/RIP检测LncRNA是否靶基因mRNA互作
➤ PCR检测LncRNA与靶基因mRNA是否形成双链
➤ α-amaniti处理
你是不是看文字感觉还有点懵呢,来,小编让你不再懵 。因为我们有它~~~~
荔枝微课【 LncNRA专题 】
课程目录:
LncRNA Disease数据库使用教程
LncRNA编码能力预测
LncRNA亚细胞定位预测
查找LncRNA启动子及预测转录因子
查找LncRNA和其靶基因的结合位点
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