当地时间6月13日，以色列民防部门发布消息称，在伊朗的导弹袭击中已有21人受伤，其中2人伤势严重。伊朗军方表示击落了两架以军战机，并拦截了十余架以色列无人机。早些时候，伊朗军方称其防空系统击落至少一架以色列战机，并逮捕了战机飞行员，但这一消息被以色列国防军发言人否认。

同日，以色列国防部长卡茨发表声明称，以军将继续保护以色列国土和国民，伊朗将因其行为付出代价。伊朗最高领导人哈梅内伊通过官方媒体发表声明，称伊朗武装部队将采取武力行动，彻底摧毁以色列政权。

当天晚上，伊朗发动了第三波导弹袭击，向以色列方向发射约150枚导弹。据以色列军方消息人士透露，美国正在帮助以色列拦截来自伊朗的导弹，美军的萨德反导系统参与了拦截行动。两名美国官员也证实，美国军方协助击落了射向以色列的伊朗导弹。

此外，有报道指出，以色列在伊朗境内发动的袭击已造成至少110人死亡，另有数百人受伤。