美国总统特朗普宣布以色列和伊朗就“全面彻底停火”达成一致，但在停火前，多名伊朗核科学家遭到暗杀。以色列驻法国大使约书亚·扎尔卡认为这些科学家的消失足以让伊朗核计划倒退多年，但伊朗方面强调不会停止包括铀浓缩在内的核活动。伊朗常驻国际原子能机构代表礼萨·纳贾菲表示，美以轰炸伊朗核设施的决定造成了“无法弥补的打击”，并称现有的《不扩散核武器条约》框架已经失效。

据伊朗英语新闻电视台报道，6月24日凌晨，伊朗核科学家穆罕默德·礼萨·塞迪奇·萨比尔在以色列对德黑兰北部的空袭中丧生。今年早些时候，美国国务院和财政部曾对他实施制裁，理由是他与伊朗核计划有联系。美国国务院指控他是伊朗防御创新和研究组织一个爆炸相关项目小组的负责人，参与了核爆炸装置的研究和测试。

伊朗塔斯尼姆通讯社还报道称，伊朗核科学家赛义德·穆斯塔法·萨达蒂-阿马基和他的家人也在以色列对德黑兰的空袭中丧生。塔斯尼姆通讯社指出，在这次袭击中，以色列故意将与军事事务无关的居民区和平民列为袭击目标。此前，塔斯尼姆通讯社报道已有六位伊朗核科学家在这次冲突中丧生。

自以色列6月13日对伊朗发动大规模空袭以来，以军已针对性地暗杀了多名伊朗核科学家。以色列国防军曾宣布通过军事行动暗杀了九名伊朗核科学家，称这些科学家为伊朗获得核武器的计划做出过贡献。以色列驻法国大使约书亚·扎尔卡在接受采访时称，以军已杀死至少十四名伊朗核科学家，他们的消失基本上是让伊朗的核计划倒退了好几年。

特朗普在23日晚间发布了以伊停火计划，停火将在美国东部时间24日0时左右（北京时间12时）生效，并分阶段实施。然而，在停火计划宣布到生效前的几个小时里，以色列和伊朗并未停止攻击。以军称摧毁了伊朗西部的导弹发射装置，而伊朗向以色列发射了六波导弹。特朗普宣布停火生效后，以军又宣称伊朗向以色列发射导弹，以色列国防部长卡茨指示以军作出“有力回应”，猛烈打击伊朗首都德黑兰市中心的目标。但伊朗武装部队总参谋部否认在停火生效后向以色列发射导弹。

对此，特朗普严厉指责以色列和伊朗双方均违反停火协议，并特别表达了对以色列的不满。特朗普还声称，在美国22日对伊朗核设施发动空袭后，伊朗“永远”无法恢复其核计划。以色列总理内塔尼亚胡办公室随后发布声明称，以色列已对伊朗德黑兰附近的一个雷达阵列发动了攻击，以回应“伊朗违反停火协议的行为”。声明还称，在内塔尼亚胡与特朗普通话后，以色列停止了“进一步的攻击行动”，以色列“已实现其所有战争目标”。

针对此次冲突，伊朗总统佩泽希齐扬表示伊朗已准备好进行对话，并努力在谈判桌上争取伊朗人民的合法权利。不过，这并不意味着伊朗会放弃铀浓缩能力。伊朗原子能组织负责人伊斯拉米表示，伊朗正在评估核设施遭受的破坏，已提前作出一系列安排以恢复核活动。他强调，为防止核工业生产过程中出现问题，伊朗已制定了多项计划。伊朗原子能组织发言人贝赫鲁兹·卡迈勒万迪则表示，伊朗有能力继续推动核工业进步，“敌人不可能将这项技术连根拔起。”

美国彭博社发文称，在冲突发生前，国际原子能机构监测员对伊朗申报的铀库存进行了细致跟踪，确保这些材料得到统计，没有被用于武器化。但在以色列发动空袭后，伊朗将核材料转移到一个“未经申报的设施”中，使得IAEA难以继续追踪其去向。伊朗常驻IAEA代表礼萨·纳贾菲表示，以色列和美国决定轰炸伊朗核设施，而不是坚持通过外交渠道进行谈判，对《不扩散核武器条约》的完整性造成了“无法弥补的打击”，“现有的《不扩散核武器条约》框架已经失效”。伊朗总统佩泽希齐扬曾表示，伊朗多次表明从未寻求生产核武器，“现在没有，将来也不会寻求核武器”。他补充说，伊朗准备在国际法框架内就其和平核活动提供保障和建立信任措施，但同时，根据国际法，也不会放弃拥有和平核能力的权利。